HYPERCHEM
Program HyperChem, merupakan program kimia aplikasi 32
bit, yang dikembangkan oleh HyperCube Inc untuk system operasi Windows
95/98 dan Windows NT. HyperChem merupakan program yang handal dari
pemodelan molekul yang telah diakui mudah digunakan, fleksibel dan
berkualitas. Dengan menggunakan visualisasi dan animasi tiga
dimensi hasil perhitungan kimia kuantum, mekanika dan
dinamika molekular, menjadikan HyperChem terasa sangat mudah digunakan
dibandingkan dengan program kimia kuantum yang lain.
Hyperchem,
merupakan tools dasar dalam molecular modeling. Software ini dapat
digunakan untuk menggambar struktur kimia, optimasi geometri dengan
berbagai macam model, study molecular dinamik dasar, study QSAR, dll.
HyperChem ialah
suatu program simulasi dan pemodelan molekular yang memungkinkan
perhitungan kimiawi yang kompleks. HyperChem mencakup fungsi-fungsi
berikut:
1. Membuat
sketsa dwimatra (2D) molekul dari atom-atom penyusunnya, lalu
mengubahnya menjadi model trimatra (3D) dengan HyperChem Model Builder.
2. Memilih
residu-residu standar secara berurutan dari perpustakaan asam amino dan
nukleotida HyperChem/Lite untuk membangun protein dan asam nukleat.
3. Membaca
tipe atom dan koordinat molekular yang telah disimpan sebagai arsip HIN
(masukan HyperChem yang dibuat sebelumnya) atau arsip ENT (mengambil
dari sumber lain, yaitu Brookhaven Protein Data Bank/PDB)
4. Menata kembali molekul, misalnya dengan memutar atau menggesernya.
5. Mengubah kondisi tampilan, termasuk penampakan ruang, model molekul, dan label struktural.
6. Merancang dan melakukan perhitungan kimiawi, termasuk dinamika molekular.
Tersedia berbagai metode mekanika molekular maupun mekanika kuantum (semiempiris atau ab initio).
Perhitungan mekanika molekular menggunakan medan gaya MM+, AM-BER,
BIO+, atau OPLS, sedangkan mekanika kuantum semiempiris meliputi extended Hückel, CNDO, INDO, MINDO3, MNDO, AM1, PM3, ZINDO/I, dan ZINDO/S.
7. Penetapan efek isotop dalam perhitungan analisis vibrasional untuk metode-metode SCF ab initio dan semiempiris.
8. Membuat grafik Excel dari hasil perhitungan kimiawi.
9. Mensolvasikan molekul dalam kotak periodik.
Program
Kimia menyediakan fasilitas pembuatan model tiga dimensi (3D),
perhitungan mekanika molekular dan mekanika kuantum (semiempiris dan ab initio). Disamping itu tersedia pula database dan program simulasi Monte Carlo dan molecular dynamics (MD).
Untuk mempelajarinya bisa klik (Di sini) atau jika mau tau update-an terbaru dari software ini bisa dilihat di (situs resminya Hypercham) atau mau lihat dulu tutorialnya? klik Download Tutorial Hyperchem 8 dari sini semua hanya ada 4 file.
Yaitu: Cara melakukan rendering, dasar-dasar untuk melakukan Raytrace Image, Cara mencari database molekul yang tersedia di Hyperchem, serta contoh analysis vibrasi dari molekul air.
Yaitu: Cara melakukan rendering, dasar-dasar untuk melakukan Raytrace Image, Cara mencari database molekul yang tersedia di Hyperchem, serta contoh analysis vibrasi dari molekul air.
sumber : http://urip.wordpress.com , http://www.faikshare.com , Harno D Prawono (Kimia komputasi) dan adesuherman09.student.ipb.ac.id
Tidak ada komentar:
Posting Komentar