All About Chemistry

Rabu, 04 Januari 2012

Cara Install KNOPPIX

Distribusi Homepage: Knoppix.org

Minimum Flash Drive Kapasitas: 1GB

Persistent Fitur: Ya

Anda akan memerlukan berikut ini untuk membuat Knoppix Portable:

1GB atau lebih besar USB Flash Pen Drive (FAT32 diformat)
Windows PC untuk melakukan konversi (XP atau Vista)
Knoppix Linux ISO
USB-Installer-Untuk-Knoppix5.1.exe

Instalasi Knoppix 5.1.1 ke Flash Drive:

Tutorial ini sudah usang! Silakan gunakan USB Universal Installergantinya.

Download Knoppix Linux ISO
Jalankan Installer USB Untuk Knoppix 5.1 dan ikuti petunjuk pada layar
Reboot PC Anda dan mengatur sistem anda atau Boot MenuBIOS untuk boot dari perangkat USB, simpan perubahan Andadan reboot

Setelah reboot, Anda harus memiliki keberhasilan peluncuranKnoppix Linux dari USB memory stick.

Buat Persistent Knoppix, menggunakan tutorial ini Buat disk image KNOPPIX persisten

Catatan: Jika Anda membutuhkan bantuan tambahan membuat booting flash drive Anda, periksa kami BIOS opsi boot yangbagian atau USB Bagian Peralatan.

sumber : http://www.pendrivelinux.com/

Apa itu Knoppix?

Knoppix adalah distro Linux live-cd yang dapat dijalankan melalui CD-ROM tanpa instalasi di hard disk. Distro ini berbasis Debian Linux dan diciptakan oleh Klaus Knopper. Knoppix memiliki ragam aplikasi yang cukup lengkap dan dapat dipergunakan sebagai demo atau sarana belajar Linux bagi yang belum mempunyai ruang pada hard disknya. Knoppix juga dapat dipergunakan sebagai CD rescue.

Knoppix, atau KNOPPIX (putar / k ᵊ nɒpɪks / k-nop-IKS), adalah sistem operasi berbasis pada Debian dirancang untuk dijalankan langsung dari CD / DVD (Live CD) atau kunci USB(Live USB), salah satu yang pertama dari jenisnya untuk setiap sistem operasi.

KNOPPIX adalah kompilasi CD atau DVD bootable dari GNU / Linux, deteksi hardware otomatis dan dukungan untuk banyak kartu grafis, kartu suara, SCSI dan USB perangkat dan peripheral. KNOPPIX dapat diadaptasi dan digunakan sebagai sistem Linux produktif untuk CD, desktop pendidikan,sistem penyelamatan, atau sebagai platform untuk demo produk software komersial. Tidak ada instalasi hard disk diperlukan. CD dapat diinstal hingga 2 GB perangkat lunak dieksekusi dengan dekompresi transparan (dalam "Maxi" edisi DVD lebih dari 9 gigabyte).

Meskipun Knoppix adalah terutama dirancang untuk digunakansebagai Live CD, juga dapat diinstal pada hard disk seperti sistem operasi khas. Komputer yang mendukung boot dariperangkat USB dapat memuat Knoppix dari flash drive USB hidup atau kartu memori.

Kelemahan dari Knoppix adalah diperlukannya memori yang besar untuk menggunakan modus grafisnya yaitu 96 MB walaupun bisa juga dijalankan pada memori 64 MB dengan swap pada hard disk.

Sejak April 2008, mulai versi 4 sampai 5.1.1, Knoppix diedarkan dalam edisi DVD "maxi" (sekitar 9GB perangkat lunak), dan edisi CD "light", keduanya dikembangkan bersamaan

sumber : en.wikipedia.org/wiki/Knoppix, id.wikipedia.org/wiki/Knoppix, www.knoppix.org/

Penggunaan Komputasi dalam Bidang Kedokteran

Penggunaan Komputasi

Salah satu contoh penggunaan komputasi adalah dalam bidang kedokteran, yaitu dalam pencarian obat. Untuk meramalkan aktivitas sejumlah besar calon obat, seorang praktisi komputasi meniru suasana pengujian aktivitasnya di laboratorium basah dengan model-model Kimia (seperti: struktur 3 dimensi calon obat) sebagai pengganti bahan-bahan laboratorium tersebut. Model-model ini kemudian dinyatakan di dalam persamaan-persamaan Matematika yang kemudian diselesaikan oleh komputer dengan kapasitas dan kelajuan yang melebihi kapasitas dan kelajuan manusia. Hasilnya berupa suatu bilangan bagi tiap calon obat yang dapat dibandingkan satu dengan yang lainnya. Perbandingan ini merupakan ramalan tingkat aktivitas suatu calon obat relatif terhadap calon obat lainnya. Demikianlah cara meramalkan aktivitas calon obat dengan metode komputasi. Dengan demikian, calon-calon obat yang diramalkan akan memberikan aktivitas yang rendah dapat dihindari.

sumber : ilhamsk.com/pengantar-komputasi-modern/

Minggu, 01 Januari 2012

ChemOffice

ChemDraw pro versi 8.0 merupakan salah satu program aplikasi dari Chem Office, untuk menggambar struktur 2D dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia organik, biokimia, dan polimer. Software ini dapat membantu anda dalam menggambar struktur kimia dengan berbagai fasilitasnya, hanya dengan mengkliknya, tool tersebut akan bekerja untuk anda.

Tool-tool dalam ChemDraw mewakili berbagai macam bentuk ikatan yang dapat anda susun menjadi struktur kimia sehingga tidaklah sulit bagi anda untuk menggambarkan struktur yang kompleks sekalipun, bahkan juga dalam berbagai bentuk konformasi dan dalam bentuk proyeksi.

Struktur-struktur tertentu yang telah umum dapat digambar secara langsung dengan mengklik tool, seperti struktur cincin benzena, siklopentana, sikloheksana dan senyawa siklis yang lain. Tool dalam ChemDraw juga menyajikan gambar struktur untuk asam amino, DNA, dan RNA yang terdapat dalam template, anda tinggal klik, membawanya ke layar, drag, maka jadilah gambar struktur anda.

ChemDraw merupakan program aplikasi untuk menggambar yang di lengkapi dengan tool-tool sehingga pengguna dapat dengan mudah membuat gambar yang diinginkannya hanya dengan mengklik tool-tool tersebut, dengan ChemDraw anda tidak akan mengalami kesulitan di dalam membuat struktur kimia. Hal ini tentu sangat membantu anda dalam menulis skripsi, thesis, karya ilmiah, ataupun jurnal, bahkan anda juga dapat mengkomunikasikan struktur yang anda miliki ke dunia web jika komputer anda di lengkapi dengan program aplikasi ChemOffice yang lain. Gambar yang telah anda buat juga dapat dengan mudah dicetak atau dibawah ke dalam program aplikasi lain seperti Ms. Word.

ChemDraw juga dapat menganalisis struktur kimia yang telah kita gambar dengan menggunakan Analys Struktur pada menu Structure, di sini anda dapat mengetahui sifat-sifat fisik struktur tersebut, misalnya, titik didih, titik leleh, berat molekul, temperatur, tekanan, dll.

BlankOn 7.0 Pattimura

BlankOn 7.0 Pattimura merupakan versi terbaru distribusi BlankOn. Distribusi ini dikembangkan oleh Yayasan Penggerak Linux Indonesia (YPLI) dan Tim Pengembang BlankOn. BlankOn merupakan distribusi linux khas Indonesia yang menyertakan beragam perangkat lunak yang sering digunakan oleh masyarakat pada umumnya, seperti program perkantoran, aplikasi keuangan, aplikasi Internet, menggambar (baik vektor maupun bitmap), dukungan untuk memainkan beragam format berkas multimedia, serta aplikasi menarik lainnya.

Pengembangan BlankOn bukan semata-mata ingin membuat distribusi Linux baru, namun lebih dimotivasi oleh keinginan untuk meningkatkan kualitas dan kuantitas dalam kemampuan pengembangan perangkat lunak bebas/terbuka. Yang pada hakikatnya merupakan salah ciri khas bangsa Indonesia yang memiliki semangat bergotong-royong.

Tim pengembang BlankOn percaya bahwa bangsa Indonesia mampu dan tidak kalah dengan bangsa-bangsa lain di dunia. Oleh karena itu kami aktif mengundang siapa pun yang berminat dan memiliki semangat yang sama untuk bergabung dalam pengembangan BlankOn.

Nama kode Pattimura diambil dari nama Pahlawan Nasional Indonesia, Thomas Matulessy yang juga dikenal dengan nama Pattimura.

Yang Baru di BlankOn 7.0 Pattimura
BlankOn 7.0 Pattimura mempunyai beberapa fitur aplikasi yang memudahkan Anda untuk membantu pekerjaan setiap hari, menikmati hiburan, behubungan melalui fasilitas internet sampai aplikasi pendidikan.

Aksara Nusantara
Pattimura mendukung enam jenis '''Aksara Nusantara''', yaitu aksara Bugis, Batak Toba, Bali, Sunda, Rejang dan Jawa. Aksara-aksara ini adalah aksara khas daerah yang terdapat di daerah Indonesia. Aksara Rejang dan Jawa merupakan penambahan terbaru di versi ini.

Kamus cepat Stardict
Pattimura menyediakan Kamus Stardict yang mendukung penerjemahan Bahasa Inggris ke Bahasa Indonesia dan Bahasa Indonesia ke Bahasa Inggris. Terjemahan lain yang disediakan melalui Lumbung Paket BlankOn adalah Bahasa Sunda Ke Indonesia dan Bahasa Sunda ke Bahasa Indonesia, Kamus Besar Bahasa Indonesia, serta Tesaurus Bahasa Indonesia.

Peramban web Chromium
Pattimura menyertakan peramban web Chromium versi 15 untuk akses cepat ke website kesukaan Anda. Ringan, mudah digunakan dan aman dan sudah mendukung HTML5.

Pemutar lagu Exaile
BlankOn mendukung penuh terhadap dunia hiburan dan dunia desain grafis, Anda bisa menikmati menonton film, mendengarkan musik serta melakukan desain grafis dengan perangkat lunak bebas/terbuka seperti gimp, Inkscape, dan sebagainya.

Modem USB flip-flop
Akhir-akhir ini sedang booming modem USB flip-flop di mana para pengguna takut jika usb modem mereka tidak terdeteksi di berbagai macam distribusi Linux. BlankOn 7.0 Pattimura mendukung beragam model dan merek modem USB yang beredar di tanah air sehingga Anda tidak perlu lagi khawatir. Tancap modem dan Anda siap berselancar di Internet dengan BlankOn 7.0 Pattimura.
Album foto Shotwell

BlankOn 7.0 Pattimura menyediakan program album foto Shotwell yang memudahkan Anda dalam mengatur puluhan bahkan ratusan ribu foto digital dalam komputer Anda. Anda dapat dengan mudah pula mengirim foto-foto tersebut ke layanan album foto populer di Internet baik Flickr, Facebook, maupun Picasa.

Lumbung Paket BlankOn
Lumbung Paket di BlankOn menyediakan ribuan aplikasi yang dapat dipasang langsung melalui sambungan internet.

Tim Pengembang BlankOn juga menyediakan lumbung paket dalam DVD yang dapat diperoleh dari alamat: http://arsip.blankonlinux.or.id/dvdrepo/
Unduh sekarang juga!

BlankOn 7.0 Pattimura dapat diunduh dari Pusat Unduhan CD BlankOn berupa Live CD.

Terlepas dari apapun sistem operasi yang Anda jalankan, Live CD akan memberi keuntungan lebih, lengkap dengan aplikasi umum, semua berjalan dari drive CD Anda - hard drive Anda tidak akan disentuh sama sekali. Dan Apabila Anda menginginkan BlankOn Pattimura berjalan dengan kecepatan penuh maka pasang BlankOn Pattimura ke komputer Anda.

Pengguna lama BlankOn versi sebelumnya juga dapat menaikkan versi ke versi 7 melalui program Synaptic yang tersedia.

sumber : http://www.blankonlinux.or.id/

HYPERCHEM

Program HyperChem, merupakan program kimia aplikasi 32 bit, yang dikembangkan oleh HyperCube Inc untuk system operasi Windows 95/98 dan Windows NT. HyperChem merupakan program yang handal dari pemodelan molekul yang telah diakui mudah digunakan, fleksibel dan berkualitas. Dengan menggunakan visualisasi dan animasi tiga dimensi hasil perhitungan kimia kuantum, mekanika dan dinamika molekular, menjadikan HyperChem terasa sangat mudah digunakan dibandingkan dengan program kimia kuantum yang lain.

Hyperchem, merupakan tools dasar dalam molecular modeling. Software ini dapat digunakan untuk menggambar struktur kimia, optimasi geometri dengan berbagai macam model, study molecular dinamik dasar, study QSAR, dll.

HyperChem ialah suatu program simulasi dan pemodelan molekular yang memungkinkan perhitungan kimiawi yang kompleks. HyperChem mencakup fungsi-fungsi berikut:

1. Membuat sketsa dwimatra (2D) molekul dari atom-atom penyusunnya, lalu mengubahnya menjadi model trimatra (3D) dengan HyperChem Model Builder.

2. Memilih residu-residu standar secara berurutan dari perpustakaan asam amino dan nukleotida HyperChem/Lite untuk membangun protein dan asam nukleat.

3. Membaca tipe atom dan koordinat molekular yang telah disimpan sebagai arsip HIN (masukan HyperChem yang dibuat sebelumnya) atau arsip ENT (mengambil dari sumber lain, yaitu Brookhaven Protein Data Bank/PDB)

4. Menata kembali molekul, misalnya dengan memutar atau menggesernya.

5. Mengubah kondisi tampilan, termasuk penampakan ruang, model molekul, dan label struktural.

6. Merancang dan melakukan perhitungan kimiawi, termasuk dinamika molekular.

Tersedia berbagai metode mekanika molekular maupun mekanika kuantum (semiempiris atau ab initio). Perhitungan mekanika molekular menggunakan medan gaya MM+, AM-BER, BIO+, atau OPLS, sedangkan mekanika kuantum semiempiris meliputi extended Hückel, CNDO, INDO, MINDO3, MNDO, AM1, PM3, ZINDO/I, dan ZINDO/S.

7. Penetapan efek isotop dalam perhitungan analisis vibrasional untuk metode-metode SCF ab initio dan semiempiris.

8. Membuat grafik Excel dari hasil perhitungan kimiawi.

9. Mensolvasikan molekul dalam kotak periodik.

Program Kimia menyediakan fasilitas pembuatan model tiga dimensi (3D), perhitungan mekanika molekular dan mekanika kuantum (semiempiris dan ab initio). Disamping itu tersedia pula database dan program simulasi Monte Carlo dan molecular dynamics (MD).

Untuk mempelajarinya bisa klik (Di sini) atau jika mau tau update-an terbaru dari software ini bisa dilihat di (situs resminya Hypercham) atau mau lihat dulu tutorialnya? klik Download Tutorial Hyperchem 8 dari sini semua hanya ada 4 file.
Yaitu: Cara melakukan rendering, dasar-dasar untuk melakukan Raytrace Image, Cara mencari database molekul yang tersedia di Hyperchem, serta contoh analysis vibrasi dari molekul air.

sumber : http://urip.wordpress.com , http://www.faikshare.com , Harno D Prawono (Kimia komputasi) dan adesuherman09.student.ipb.ac.id

Chem Draw

ChemDraw

ChemDraw Ultra 12.0 Suite

Aplikasi untuk menggambar struktur molekul diantaranya ChemDraw Ultra 12,0, ChemDraw / Excel 12,0 (W), MNova Std / Lite (W), Chem3D Pro 12,0 (W), ChemBioFinder Std 12,0 (W), yang ChemDraw dan ActiveX Kontrol Chem3D Pro & Plugins (W ), ChemBioFinder / Kantor 12,0 (W) dan ChemINDEX (Index, rxn, NCI & AIDS) Database.

ChemDraw Ultra 12,0 menambah Pro 12,0 Chem3D aplikasi, serta fitur ChemDraw Ultra seperti struktur = Nama, ChemNMR, Database Gateway Livelink, yang Livelink Chem3D, ClogP / CMR, Kotak Stoikiometri, ChemDraw / Excel, ChemBioFinder / Kantor (W) untuk ChemDraw Pro 12,0.

Namun aplikasi yang super komplit ini harus membayar bila ingin mendapatkan Lisensi yang asli. yaitu sebesar US$ 380/tahun

untuk lebih lanjut ingin mengetahuinya dapat mengunjungi webnya.

ChemDraw Ultra 12.0 sekarang tersedia:

Urutan perangkat dengan ikatan disulfida, urutan pembungkus dan pembentukan
Struktur>Nama yang mendukung struktur tersebut dengan penambahan penamaan pada suatu ring.
Nama>Pengenalan nama pada struktur yang ambigu Dokumen bisa lebih dari 16 juta warna

Di chemdraw kita bisa melakukan banyak hal, antara lain:

Menggambar struktur kimia.
Mengenal nama struktur kimia.
Mengetahui sifat fisik dan kimia dari suatu struktur kimia.
Mengetahui puncak-puncak dari NMR proton dan karbon.
Mengetahui stereokimia dari struktur tersebut.
dan masih banyak lagi kegunaan dari ChemDraw ini.

Jadi, sangat berguna dalam pembelajaran ilmu kimia selain dari buku.

Sumber: http://www.cambridgesoft.com/software/details/?fid=14&pid=236